実験の部屋 PCR産物を定量する〜アガロースゲルからの切り出し回収 2021年6月6日 PCR産物のDNA濃度を測定するとき、どうしていますか? 以前、一緒に研究をしていたフランスからの留学生(大学院生)がPCR産物をNanodropで測定しようとしてびっくりしたことがあります。 フランスからの留学生みたいにNanodropで測定しちゃう学生さんは意外と多いのかもしれません。 今回は、「なぜPCR産物はN... えいこ
実験の部屋 生命科学系なら知っておきたい〜DNA(核酸)の定量 2021年6月3日 DNA(核酸)サンプルを定量する時、あなたはどうしますか? 生命科学系の研究室では、DNA(核酸)のサンプルを扱うのは日常茶飯事。 何も考えずにナノドロップに向う人も多いのではないでしょうか? では、エタノール沈殿ではなくPCRで増幅させたDNAサンプルはどうやって濃度を測定していますか? 何も考えずにナノドロップ行... えいこ
実験の部屋 アガロース電気泳動を説明できますか? 2021年5月30日 生命科学系なら必ずと言って良いほどどこの研究室でも行われているアガロース電気泳動。 あなたはどれくらい説明できますか? 特に核酸を扱う場合には毎日ゲルを作っているという人も多いのではないでしょうか? 研究室では常識と化している「アガロース電気泳動」ですが、その原理から様々な試薬の使い分けまでまとめておきましょう。 核... えいこ
実験の部屋 シークエンスを出す人は知らなきゃいけない?!「サンガー法」とは? 2021年5月27日 生命科学をやっている人なら一度は出したことはある「シークエンス」。 構築したプラスミドの配列が正しいかどうか?ゲノム編集した部分がきちんとゲノム編集されているかどうか?など目では見えない塩基配列を解析する時には「シークエンスに出す」は常識ですよね。 その「シークエンス」、どうやって「読まれているか」ご存知ですか?きちん... えいこ
実験の部屋 研究室では教えてくれない?!「IRES」ってなに? 2021年5月23日 「クローニング」をして、目的遺伝子を導入したときに目的遺伝子が発現しているかどうか確認する必要があります。 直接的に目的遺伝子の発現を見るのであれば、mRNAのレベルではRT-PCR、タンパク質のレベルではウェスタンブロッティングを行えばOKです。 が、もっと簡単に目的遺伝子が導入できているかどうか確認できたら良いです... えいこ
実験の部屋 クローニングするなら知っておきたい「プラスミドマップ」の見方 2021年5月20日 生命科学系の学生さんだったら必ずといって良いほどやるのが「クローニング」ではないでしょうか? 「クローニング」を始める前に、できるようになっておかなければいけないこと、それが「プラスミドマップ」を読むことです。 「クローニング」をするにしても、増やしたい遺伝子をのせるベクターがどんな構造をしていて、どう言う手順を踏んだ... えいこ
実験の部屋 生命科学系なら必ずやる「クローニング」って何? 2021年5月16日 生命科学系の研究室に所属しているなら、分野を問わず必ずと言っても良いほどやるのが「クローニング」ではないでしょうか? 必ずと言っても良いほどやるのに、研究室に配属された学生さんにほとんど説明されなかったりもするのです。 (研究室にいる人にとっては、あまりにも当たり前のことだからなのかも...) そこで「クローニングって... えいこ
実験の部屋 細胞の増殖速度と倍加時間を計算する 2021年5月13日 培養細胞を扱うときに、最初にやるのではないかと言うのは増殖曲線を描くことではないでしょうか? 増殖曲線を描くというのは、実験のデザイン、培養細胞の扱い方、正確な実験操作・計数、毎日細胞に触れるなど、実験が上手くなるために必要な要素が凝縮されているのです。 今回は増殖曲線を描くために得られたデータから扱っている細胞の特徴... えいこ
実験の部屋 細胞を数えよう!血球計数盤の使い方 2021年5月6日 細胞培養をやっていて必ずと言って良いほどやるのが、血球計数盤を使った細胞の計数です。 研究室できちんと教えてもらえないところも多いかもしれません。 この記事では、血球計数盤の使い方について簡単にまとめていきましょう。 細胞を数える前に生細胞と死細胞を見分ける なぜ、細胞を数えるのか? 増殖曲線を描きたい、細胞を継代した... えいこ
実験の部屋 培養細胞の増殖曲線を描く 2021年4月15日 初めて扱う細胞がどんな振る舞いをするのか? それを知るために最初にすることは、細胞の増殖曲線を描くことです。 扱う細胞が変わったり、適切な培養条件を検討したり、培養条件を変えたり(血清のロットチェックなど)するときに必ず描くのが「増殖曲線」です。 どうやって描くのか?描いた後どうやって評価するのか?などをまとめていきま... えいこ